Que bom! Ao menos descartamos esta possibilidade de custo adicional para você.
Isto pode ser algum indicativo de que a forma como está instalando os sistemas não esteja completamente correta…
Já que você fez essa tentativa. Não sei se foi assim que você procedeu, mas vou te sugerir, caso não tenha feito, que na próxima vez tente excluir todas as partições com sua versão live do linux. Em seguida Inicie a instalação do Windows, crie todas as partições do Windows, deixando o espaço livre destinado para o linux. Depois, dê o boot com sua mídia do linux criando todas as partições e instalando ele.
Acredito que esta parte pode ser algum problema para reconhecer ela sim. Mas pode ser algo deixado para se preocupar depois que resolver o seu problema com o Dual Boot. Já que até que se resolva o primeiro problema, pode ser necessário formatar mais vezes.
Existe um tópico aqui onde é abordado detalhadamente a questão sobre o processo de Dual Boot. Tenta seguir também as dicas que tem lá.
Ao final de tudo, quando seu Dual Boot estiver iniciando sem problemas os dois sistemas, pode-se procurar a solução para sua GPU.