Olá @Bruno123, tudo bem contigo?
Ao usar um sistema customizado por terceiros sempre existe o risco que o autor/dev ter feito ajustes manuais para chegar em um determinado resultado e isso pode deixar o sistema inconsistente. O BC é um pacote comum do Debian e vem instalado por padrão, se o autor removeu é preciso dar uma checada nisso.
Em teoria, se você não instalou manualmente nada externo ao sistema, o APT deve ser capaz de fazer os ajustes necessários. Os pacotes marcados como órfãos que seriam removidos, quebrariam a instalação do sistema?
Só recomendo fazer isso se você está 100% confiante, porque basicamente isso significa que você tomou para si a responsabilidade de validar manualmente pacotes que serão instalados e o APT/DPKG não vão mais interferir em suas ações. A menos que você use um sistema altamente customizado, geralmente o esforço na manutenção não vale o possível ganho em controle (na minha opinião).
Analise os pacotes originais do sistema antes da instalação do BC (use uma VM ou live-pendrive para isso) e veja se essa customização usava outra versão do BC customizada pelo autor ou se o pacote BC tem dependências que afetem seu sistema. Sugiro dar uma lida neste artigo, ele tem várias informações interessantes sobre configuração de ambientes Debian.
