Bom, para muitos isso esse tutorial deve ser meio obvio, mas para mim não era. Então vou eternizar ela aqui, para quem precisar futuramente.
Tive diversos problemas com a versão do Musescore 3 em flatpak, snap e appimage, então fui a procura de um método que fosse mais funcional. Depois de tempos de tortura encontrei o método via ppa. Que no caso é o fato de adicionar um repositório novo no ubuntu.
Primeiramente abra o terminal, depois adicione o ppa e instale o programa com estes comandos:
sudo add-apt-repository ppa:mscore-ubuntu/mscore3-stable -y
sudo apt update
sudo apt install musescore3
E voilá, pronto. Pode fazer suas partituras no programa atualizado e com todos os recursos.
Fácil assim. 