Seja bem vindo ao fórum @Theus-C!
Não sei exatamente como é configurado no Nemo, mas posso te ajudar em como configuro no Thunar, pode ser que seja semelhante.
Para funcionar corretamente no thunar é necessário acrescentar o parâmetro %f, por exemplo:
exo-open --working-directory %f --launch TerminalEmulator
Seguem mais detalhes: Acrescentando funções ao Thunar (gerenciador de arquivos)