Você foi salvar o arquivo a partir de um aplicativo flatpak? Pode ser necessário instalar o tema dark no flatpak.
Digite flatpak list no terminal e veja se o tema já está instalado.
Digite flatpak search theme para pesquisar por temas para o flatpak.
Para instalar digite flatpak install ID Aplicativo . Exemplo: flatpak install org.gtk.Gtk3theme.Pop-dark