Esse problema acontece porque a decodificação de vídeo por hardware ainda é um baita problema nos navegadores para o GNU/Linux. A decodificação por software, usando o processador, é um processo extremamente ineficiente e, por isso, vídeos engasgam.
Você pode experimentar a nova versão do Chromium no Flathub com VA-API habilitado: O Navegador Chromium agora está disponível no FlatHub de forma oficial