Para limpar o acúmulo de coisas antigas em uma parte da pasta /home:
find ~/.cache/ -type f -atime +365 -delete
(Esse cache guarda coisas, para agilizar da próxima vez que forem necessárias. – O comando elimina as que têm mais de 1 ano).
Para limpar outro cache – o dos pacotes baixados, que já foram instalados:
sudo apt clean
(No meu caso, configurei para sempre deletá-los, depois que são instalados. – Por isso, nunca se acumulam nas minhas distros).
Talvez isso ajude. – Veja se diminuiu a ocupação da partição RAIZ.