Já trouxe em outro tópico algo parecido sobre um banco muito famoso que usa linux com google docs há anos; não posso entrar em detalhes pois não tenho autorização para isso.
Eu acompanho esse tema há muito tempo e coloquei um ponto final sobre a mesma dúvida que você tem. Para mim, já não existem mais barreiras. O Linux alcançou um patamar muito alto e está sendo usado amplamente em várias empresas, tanto no desktop quanto na infraestrutura que suporta o negócio.
Talvez seja uma questão de tempo para você perceber ou pesquisar mais casos em que os pontos que você trouxe já são uma realidade.
Outro ponto interessante da sua pergunta é sobre ‘trocar o sistema’. Se você pesquisar por cima sobre transições de processos empresariais, vai perceber que se gasta tempo e dinheiro. Não dá para simplesmente chegar na segunda-feira e trocar todos os sistemas dos terminais.
Isso requer planejamento, testes e muita paciência. Para uma empresa 100% Microsoft migrar para soluções que as distribuições Linux oferecem, é necessária uma série pesada de levantamentos de requisitos, documentações atualizadas e configurações.
É possível, mas o foco da empresa no momento é vender o produto/serviço que ela se propôs a entregar, em vez de se preocupar com Windows ou distro Linux.
Lembrando que o time que presta suporte para os colaboradores também pode não ser especialista em Linux, o que demandaria a troca da equipe de TI ou investimentos em treinamento.
Só para fechar o tema, trocar o sistema operacional de toda uma empresa da noite para o dia está longe de ser a forma correta. Essa transição poderia levar anos e teria que ter um plano muito sólido, com etapas muito bem desenhadas, para que aconteça com sucesso.
E novamente: o objetivo do negócio é vender o que foi proposto. Se uma fábrica nasce com o objetivo de atender à demanda da população por refrigerante, o foco e a preocupação estão no produto, não na ferramenta que ajuda o produto a ser fabricado.
A mudança só será feita quando o assunto ‘sistema operacional’ estiver impactando a produção do produto. Aí sim, com certeza, o foco será no planejamento da migração para garantir que um novo sistema operacional assuma o controle.