Tutorial atualizado 08/07/2021 (Fedora 34)
Flatpak’s são programas distribuídos por vários projetos, um dos mais famosos é o Flathub. Adicionando seu suporte você terá maior variedade de programas disponível para seu sistema.
Você pode gerenciar flatpak’s via interface gráfica no GNOME Software ou Discover (do KDE) basta ter o pacote “flatpak” instalado (se caso tiver o GNOME Software instalado já terá o flatpak também) então basta adicionar o flathub, caso não:
No terminal instale o flatpak:
sudo dnf install flatpak
Adicionando o flathub via terminal:
obs: você pode adicionar apenas para seu usuário (adicionando o “–user” na linha de comando) assim apenas você terá acesso aos flatpak’s instalados, além de ficarem todos na sua home (não ocupando espaço do sistema raiz “/”)
flatpak remote-add --if-not-exists flathub https://flathub.org/repo/flathub.flatpakrepo
E Reinicie.
Adicionando Flathub via GUI / interface gráfica:
Opção 1:
clique aqui para adicionar via GUI GNOME software / discover


Agora atualize na aba “Atualizações”
Então já poderá pesquisar e instalar mais de 700 flatpak’s do flathub atualmente:
Adicionando Flathub via GUI / interface gráfica:
Opção 2:
Acessando o flathub clique em “install” em qualquer app:
Então clique em “OK” para abrir com o GNOME Software, que se encarregará de adicionar o flathub e instalar o programa, para que os app’s apareçam na loja quando você for instalar os próximos flatpak’s:
ele carregou por alguns segundos
Ao clicar em “Instalar” na GNOME Software, irá pedir a senha, porém apenas esta vez, pois estará adicionando um novo repositório flatpak (o flathub) nas próximas não necessitará de senha:
os primeiros flatpak’s podem demorar alguns minutos dependendo da conexão[/caption]
No Discover ficará assim:
em Fontes/Flatpak
Dicas!
No KDE Plasma e outras DE’s talvez seja necessário encerrar a sessão (apenas na primeira vez) para os ícones dos flatpak’s instalados aparecerem no menu.
Para alguns flatpak’s reconhecerem outras partições ou pontos de montagem, execute o seguinte comando no terminal ex: steam
obs: pode mudar a linha em “/run/media” para qualquer ponto de montagem que você precisar, como: “/media” ou /mnt"
sudo flatpak override --filesystem=/run/media com.valvesoftware.Steam
Via Flatseal:
Exemplo da Steam, dei permissão para o /mnt onde monto meus HD’s de jogos.
Após isso já poderá adicionar partições de jogos no Steam via Flatpak.
Você pode gerenciar programas via terminal se preferir, para saber mais consulte a documentação oficial http://docs.flatpak.org/en/latest/using-flatpak.html#