Mesmo usando uma placa antiga e com o drive nouveau não aconteceu isso comigo, nem sabia que isso poderia acontecer e, caso não tivesse comentado que no Windows está funcionando, falaria que era defeito físico.
Segue essa dica de controlar a velocidade pelo fancontrol, que faz parte do lm_sensors: Controlando a velocidade do ventilador no Linux | Baeldung no Linux.
Aproveitando, vou te pedir que siga esse outro tópico: Como fornecer boas informações, para que possamos entender melhor o seu hardware e quais drivers estão sendo usados.