O Lubuntu é uma distro LTS, o que significa que as atualizações do sistema focam em estabilidade e correção de erros. É provável que o Gimp 3 só entre nos repositórios da distro quando uma nova versão do Lubuntu for lançada.
Enquanto isso, usar o flatpak é realmente a melhor forma de ter o Gimp mais atualizado disponível.
Abra o Gimp, vá em Edit/Preferences. Na tela que vai abrir, clique em Interface e depois escolha português no local indicado.
Para atualizar os flatpaks é só rodar o comando “flatpak update” no terminal ou usar a loja que vem no sistema para atualizar. Para atualziar os outros programas, recomendo usar a própria loja do sistema.
Tanto no blog quanto no Diolinux Labs tem instruções detalhadas para instalar o Photogimp.