Confira o post completo no blog: Conheça 2 excelentes softwares de conversão de áudio para Linux - Diolinux
Sound Converter e Sound Konverter. Parece nome de gêmeos, mas são dois grandes softwares de conversão de áudio para Linux. E também os meus preferidos.
Seria muito legal que o Sound Converter tivesse a função de normalizar os áudios! Há alguma alternativa em GTK?
Há tempos venho procurando um substituto para o MP3Gain do Windows para normalização de músicas MP3 sem sucesso… Agora vou testar o Sound Konverter pra ver se atende minhas necessidades e abandonar de vez o único programa que não consegui largar do Windows (executo-o via Wine no Ubuntu)
Tem o Fre:ac e gnac também
Joga uns links aí pra gente ver! 
Só para completar a informaçào.
Tem o FFMPEG
Loudness Normalization
If you want to normalize the (perceived) loudness of the file, use the loudnorm filter, which implements the EBU R128 algorithm:
ffmpeg -i input.wav -filter:a loudnorm output.wav
Suporta outros codecs
ffmpeg -i input.wav -codec:a libmp3lame -qscale:a 2 output.mp3
Mais info:
Tuto em br do edivaldobrito para extrair de vídeo