Não sei se é a solução, mas pode tentar.
Segundo o wiki do arch sobre gnome
Gnome freezes for a second after using a Function (Fn) key shortcut
Este é um problema com o teclado brasileiro ABNT2. Se você tiver o português brasileiro habilitado, o GNOME pode ter esse problema. Para corrigir este problema e continuar usando este layout de teclado, desmarque o botão scroll lock, comentando a linha em /usr/share/X11/xkb/symbols/br:
modifier_map Mod3 { Scroll_Lock };
Reinicie a sessão e veja se funciona.