como remover ícones da bandeja do gnome shell(acredito que funcione em todas as distros)
passo 1: abra essa pasta aqui nos arquivos
/usr/share/applications
Passo 2: ache o ícone que você deseja remover e abra ele no editor de textos
passo 3: digite no fim do arquivo
NoDisplay=true
Pronto e assim que você remove um ícone 