Se seu PC for mais moderno (época do Windows 8 em diante), ele deve vir com UEFI. Esse tópico se aplica:
De qualquer modo, é importante manter backup de seus arquivos importantes em um local seguro/independente do PC (especialmente as pastas ocultas /home/usuario/.config e /home/usuario/.local/share, já que você quer conservar as configurações).