Eu preferencialmente gosto de usar btrfs no / e ext4 no /home, é uma solução bastante amigável…
Podem ocorrer eventuais problemas, ao encontrá-los, sempre que possível reporte, no BTRFS Wiki eles explicam o processo.
PS: Veja antes se já possui um relato parecido com o seu e se possível, comente em inglês para que seja mais fácil de ser compreendido.