Olá,
Estou com um problema parecido entre o Windows e o Fedora 40. O Barrier conecta mas o mouse não atravessa para o Cliente (Windows).
Sou muito verde em Linux ainda e não sei o que significa wayland e xorg.
Detalhe. Ates eu utilizava sem problema com dois Windows e um PopOs.
Já busquei a informação aqui e rapidamente percebi que o Fedora está utilizando Wayland.
Como faço para mudar para xorg?
Xorg e Wayland são os servidores de interface gráfica para ter melhor desempenho por conta de drivers do vídeo. Como Barrier funciona bem no caso de xorg somente.
É possível trocar para Xorg, você vai deparar o botão no canto inferior direito na tela de login (onde você digita a senha ao ligar e/ou reiniciar) como procede o colega @wmassis 
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Consegui.
Por enquanto irei utilizar alterando para Xorg na tela de login e automaticamente o Barrier passou a funcionar.
Depois com mais calma verei uma alternativa para entrar já como padrão o Xorg.
Obrigado.
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Boa, assim que você selecionar xorg, vai ficar fixo nas próximas entradas (ao ligar e reiniciar). Caso quer retornar a usar Wayland, só reiniciar e clicar no botão na tela de login para alterar. 
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