FUNCIONOU
shutdown - “stop job is running for user manager for UID 1000”
#systemctl disable user@1000.service //não funcionou
#systemctl mask user@1000.service //it’s work! agora ta dando shutdown e
reboot no tempo certo.
Não sei muito sobre o User@.service, mas antes de desabilitar e efetuar o mask eu li que esse serviço é relacionado aos usuários que não tem o privilegio root (porém meu usuário tem). Esses conflitos devem ser por que reinstalei o sistema do / e deve ter ficado as configurações de usuário da minha /home em conflito. Não sei ao certo se pode ser isso, mas está legal. Voltou ao normal.
Enquanto a partição que ficava iniciando durando o boot; foi minha /etc/fstab que estava com o UUID da swap errado.
segue esse ótimo tutorial: https://williamcanin.me/blog/linux-boot-a-start-job-is-running-for-dev-disk-by/
que ensina a decifrar a mensagem com o número da UUID, verificar a parcição com lsblk -f e editar a fstab.