Olá @Carlos_Augusto, tudo bem contigo?
Qual é o formato do sistema de arquivos que você está utilizando no seu backup? Se você estiver usando BTRFS é possível que o Timeshift tenha criado pontos “somente de leitura” que não podem ser removidos a menos que você altere as permissões dele manualmente, usando as próprias ferramentas do BTRFS.
Neste link tem todos os comandos necessários para gerenciar snapshots somente leitura.
Para aprender mais sobre BTRFS, sugiro estudar as dicas deste guia aqui do fórum é bem completo.
