Olá @RafaelBS
Eu fiz alguns posts introdutórios sobre esse assunto:
- Construção de um pequeno aplicativo no melhor estilo hello world [Python, GTK+ 3 e Flatpak]
- [TUTORIAL] Python e Qt 5 [Parte 1]
No caso eu utilizei Python, mas o importante é notar que com o Gnome Builder você pode utilizar linguagens como:
-
C#. -
C. -
C++. -
JavaScript. -
Python. -
Vala.
Já com o Qt Creator o foco é a utilização da linguagem C++, contudo nada impede que você utilize a interface criada no Qt Creator com outras linguagens que possuam um binding para Qt.
Dependendo do que vocẽ está desenvolvendo outra possibilidade interessante pode ser a utilização do Electron.
Qualquer duvida estamos na área 
.