Penso que é a melhor solução – enquanto você não se sentir seguro. – Se não está prejudicando, melhor não mexer demais.
Espero que o efibootmgr esteja funcionando para alterar a ordem das opções de boot. – Até hoje eu só usei para isso.
Agora, só por curiosidade, resolvi fazer umas experiências malucas.
Deletei as entradas 0008 e 0009:
# efibootmgr -b 0009 -B
# efibootmgr -b 0008 -B
A entrada 0009 era do Mocaccino, que não tenho mais. – A entrada 0008 foi um erro. – Eu pretendia deletar a do MX19, mas me enganei e deletei a do MX21. 
(Tudo bem. Só uso a do openSUSE – e mantenho a do Mageia para alguma emergência).
Essas pastas não desapareceram de /boot/efi/EFI/
# ls -1 -R / | grep 'boot/efi/EFI'
/boot/efi/EFI:
/boot/efi/EFI/arch_grub:
/boot/efi/EFI/boot:
/boot/efi/EFI/Debian:
/boot/efi/EFI/fedora:
/boot/efi/EFI/mageia:
/boot/efi/EFI/Mocaccino_Linux:
/boot/efi/EFI/MX19:
/boot/efi/EFI/MX21:
/boot/efi/EFI/neon:
/boot/efi/EFI/opensuse:
/boot/efi/EFI/opensuse/fw:
/boot/efi/EFI/pclinuxos:
/boot/efi/EFI/Redcore:
/boot/efi/EFI/slackware-14.2+:
/boot/efi/EFI/ubuntu:
Para eliminar essas “respectivas pastas”, tive de usar 2 comandos – um, para esvaziá-las – outro para removê-las – usando privilégios de Administrador (su):
# rm /boot/efi/EFI/MX19/*
# rmdir /boot/efi/EFI/MX19
# rm /boot/efi/EFI/Mocaccino_Linux/*
# rmdir /boot/efi/EFI/Mocaccino_Linux
(Dessa vez, fiz a escolha certa: MX19).
Depois disso, sim, as pastas desapareceram:
Novamente pelo comando efibootmgr (usando su), deletei as entradas 0006 (ubuntu = Mint) e 0007 (MX19):
A pasta /boot/efi/EFI/ubuntu continuava lá, pois ainda faltava deletá-la:
Reiniciei o computador, entrei no UEFI Bios setup – e lá estava a entrada “ubuntu”, no final da lista – mas tinham desaparecido “Mocaccino”, “MX19” (pastas já deletadas) e “MX21” (pasta ainda existente, pois deletei só pelo efibootmgr):
Escolhi “ubuntu” – pasta ainda existente – e caí no vazio:
Até onde consigo lembrar, essa pasta ou entrada “ubuntu” pertencia ao Mint – mas houve alguma interferência entre ele e o KDE Neon, pois quando eu escolhia “neon”, o UEFI Bios me mandava para o Grub do Mint (instalado meses depois do Neon).
Os arquivos das pastas “neon” e “ubuntu” tinham a mesma data – com a diferença de 24 minutos:
Após reiniciar, efibootmgr “renumerou” as entradas: – Três opções UEFI BBS (DVD, USB, Network) assumiram os números de 0006 a 0008; sumiu “UEFI DRW pciRoot”; faltam 000C e 000D; e “ubuntu” ficou sendo 0010:
Por fim, removi a pasta “ubuntu”:
# rm /boot/efi/EFI/ubuntu/*
# rmdir /boot/efi/EFI/ubuntu