Isso é bem complicado mesmo. Mudanças muito drásticas podem acabar causando muitos problemas para quem usa a base Ubuntu. Veremos como vai ser daqui pra frente.
Além disso, esse negócio de software verificado é igual software assinado do Windows, que eu falei sobre aqui.
Tem muito software assinado que causa todo tipo de mazela no Windows, como os conhecidos otimizadores chineses, as DRMs, os anticheats e outros tipos de softwares problemáticos.