Estou usando o KDE Neon como distro principal e a Discover tem sido excelente para instalar pacotes Flatpak. Inclusive, quase todos os aplicativos que eu uso foram instalados em formato Flatpak. O KDE Neon vem limpo, sem programas pré-instalados fora as ferramentas do KDE e o Firefox (que é um .deb), o que pessoalmente considero excelente.
As buscas na loja incluem resultados em Flatpak e Snap (o que já vem pré-configurado). Há também integração de AppImages após serem executados pela primeira vez.
Bom, o Pamac, habilitando flatpaks e snaps, os integra em sua pesquisa e fluxo de atualização (neste último caso, com a exceção dos snaps, que atualizam sozinhos - Canonical blablabla ocupam muito espaço blablabla etc. e tal). Contudo, o Pamac não é apenas uma loja e sim, precisa de melhorias de UX/UI. E falta a ela a integração automática de Appimages e uso do Appimagehub.
Mas, da forma como vc fala, não me vem nenhuma à cabeça…
Se for comigo, não, sou totalmente leigo em matéria de programação
Sou apenas um entusiasta do ramo da tecnologia e me viro bem no mundo linux, mas não me arrisco na programação.