Pretendo explicar com a maior quantidade possível de detalhes o funcionamento dos 3 formatos de empacotamento, tudo de forma testável e se emitir opinião, porém voltado para o usuário não o desenvolvedor, também não pretendo ensinar linha de comando a não ser o necessário.
O AppImage pode até funcionar de maneira bem simples, mas acho muito bem-vindo para iniciantes, pois é bem semelhante aos .exe do Windows, só dar 2 cliques e ser feliz. Tá certo que o AppImage não traz as dependências junto, mas o .exe também não e mesmo assim instalar .exe’s é muito simples.
Eu também prefiro o AppImage por ser compatível com quase qualquer distro, sem precisar ficar adicionando repositórios ou instalando pacotes de comandos do bash.
AppImage é minha forma de empacotamento preferida =D