Ainda estão imensos… rs.
Se os pacotes flatpaks são grandes ou pequenos é relativo, pra mim 200 mb em um aplicativo é pequeno, e eu acho que vale a pena os apps serem um pouco mais pesados em troca de estarem sempre na mais nova versão
Podemos ver aqui uns 43 MB de Downloads (Que eu acredito representar o tamanho tomado no disco)
Aqui a gente tem uma versão desatualizada, e com acesso aos pacotes do teu sistema. Com 13MB de download e 70 MB de espaço no disco.