A nova ferramenta de captura do Gnome 42 é realmente excelente e funcional. Claro que faltam algumas coisas como anotações, mas aí já é outro passo.
Uma coisa que não entendi é porque sumiu a opção de copiar para área de trabalho. Eu, muitas das vezes, não quero salvar a imagem, mas sim copiar e jogar em algum lugar, tipo app de mensagens, etc.
Sempre que a nova ferramenta captura uma imagem, ela é salva em disco e também na área de transferência.
Então, você pode seguir colando as imagens onde quiser normalmente.
P.s.: aos menos no Debian Sid e no Arch Linux, o funcionamento padrão é este.